go test -cover `go list ./... | egrep -v 'hoge|fuga|aaa'`
おそらくこれが一番簡単だと思います -cover や -v はお好みで付与してください
-cover
-v
無視したいディレクトリ名に含まれる文字列を egrep で指定してあげるだけです 条件は OR になっているので指定した文字列が含まれるディレクトリはテスト対象外になります
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